Le Musée Agathois a ouvert ses portes le 3 août 1935, jour de la fête patronale de la ville, lors de la célébration des reliques de Saint-Etienne. L’association de l’Escolo daï Sarret, créée en 1932, est à la genèse de ce projet, son but étant «la conservation de la langue locale, de son costume traditionnel, de la célébration de la fête du Vin Nouveau et la création d’un musée».
Le Musée Agathois Jules Baudou fait partie des 1218 «Musées de France» ; seuls 7 l’ont obtenu en Languedoc-Roussillon. Cette appellation, instaurée par la loi du 4 janvier 2002 dite «loi musée», porte à la fois sur les collections et les institutions qui les mettent en valeur. Elle rend les musées qui en bénéficient éligibles aux soutiens de l’Etat, scientifiques, techniques et financiers.
Après une année de fermeture au public, pour effectuer un important chantier de ses collections ainsi qu’un traitement du mobilier par anoxie, le Musée a rouvert ses portes le 14 septembre 2012, à l’occasion des 29ème Journées du Patrimoine. Une fermeture qui a également permis de réaliser un travail de scénographie conséquent, afin de rénover et d’embellir les salles de l’Hôtel de la Charité.
Pour fêter les 80 ans du Musée Agathois Jules Baudou, la Ville d’Agde et l’Escolo daï Sarret ont décidé de proposer, de février à décembre 2015, 9 rendez-vous, chaque samedi après-midi (sauf juillet et août), au cœur des collections du Musée.